線粒體染色試劑盒使用了一個線粒體綠色熒光染料，與其它探針不同，它更少依賴于線粒體膜電位而定位于線粒體。這個染料，是一種疏水化合物，具有特殊的優點，即它在水溶液中基本上是非熒光的，并且一旦它在線粒體的脂質環境中積聚熒光會得到極大增強，并且可以染色活細胞和甲醛固定的細胞，但是在透化后，熒光信號將丟失。適用于高內涵成像，微孔板熒光測定法或流式細胞術等平臺進行熒光檢測或成像。該試劑盒適用于增殖和非增殖細胞，含懸浮細胞和貼壁細胞。能夠在多種哺乳動物細胞類型中均勻染色線粒體，不論是活細胞和固定細胞，懸浮細胞或貼壁細胞。對各種熒光分析平臺進行了優化，具有廣泛的適用性，如熒光微孔板分析，流式細胞儀和熒光顯微鏡等。除了溶組織內阿米巴、籃氏賈第鞭毛蟲以及幾種微孢子蟲外，大多數真核細胞或多或少都擁有線粒體，但它們各自擁有的線粒體在大小、數量及外觀等方面上有所不同。

    線粒體染色試劑盒擁有自身的遺傳物質和遺傳體系，但它的基因組大小有限，是一種半自主細胞器。除了為細胞提供能量外，線粒體還參與諸如細胞分化、細胞信息傳遞和細胞凋亡等過程，并擁有調控細胞生長和細胞周期的能力。